Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ATP1A4Q13733 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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