Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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