Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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SKP2Q13309 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
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SKP2Q13309 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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SKP2Q13309 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.16□□□□□ -2.22
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SKP2Q13309 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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