Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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