Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIK2Q13002 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIK2Q13002 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIK2Q13002 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIK2Q13002 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIK2Q13002 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms