Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CACNB1Q02641 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.6 ms