Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD11P31277 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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