Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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HCN4Q9Y3Q4 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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HCN4Q9Y3Q4 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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