Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTXN3Q4LDR2 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTXN3Q4LDR2 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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