Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC8.1□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC8.1□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
FOXD1Q16676 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC8.06□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms