Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTF1Q16619 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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CTF1Q16619 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
CTF1Q16619 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CTF1Q16619 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
CTF1Q16619 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -2
CTF1Q16619 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CTF1Q16619 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CTF1Q16619 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CTF1Q16619 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTF1Q16619 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTF1Q16619 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTF1Q16619 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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CTF1Q16619 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTF1Q16619 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTF1Q16619 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTF1Q16619 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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CTF1Q16619 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTF1Q16619 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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CTF1Q16619 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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CTF1Q16619 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CTF1Q16619 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTF1Q16619 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
CTF1Q16619 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CTF1Q16619 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CTF1Q16619 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CTF1Q16619 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CTF1Q16619 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTF1Q16619 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CTF1Q16619 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CTF1Q16619 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CTF1Q16619 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTF1Q16619 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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