Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms