Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PCOLCEQ15113 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms