Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RAB39AQ14964 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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RAB39AQ14964 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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RAB39AQ14964 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB39AQ14964 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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