Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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