Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
APOFQ13790 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
APOFQ13790 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
APOFQ13790 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
APOFQ13790 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
APOFQ13790 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
APOFQ13790 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
APOFQ13790 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
APOFQ13790 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
APOFQ13790 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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APOFQ13790 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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APOFQ13790 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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APOFQ13790 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
APOFQ13790 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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