Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ALCAMQ13740 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ALCAMQ13740 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ALCAMQ13740 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ALCAMQ13740 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ALCAMQ13740 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ALCAMQ13740 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ALCAMQ13740 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ALCAMQ13740 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ALCAMQ13740 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ALCAMQ13740 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ALCAMQ13740 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ALCAMQ13740 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ALCAMQ13740 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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