Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1SQ13698 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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