Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
BFSP2Q13515 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.4 ms