Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms