Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3BQ13214 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms