Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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HOXC10Q9NYD6 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
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HOXC10Q9NYD6 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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HOXC10Q9NYD6 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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HOXC10Q9NYD6 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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HOXC10Q9NYD6 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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HOXC10Q9NYD6 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXC10Q9NYD6 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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