Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHCHD4Q8N4Q1 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms