Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
C9orf135Q5VTT2 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
C9orf135Q5VTT2 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
C9orf135Q5VTT2 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
C9orf135Q5VTT2 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
C9orf135Q5VTT2 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
C9orf135Q5VTT2 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
C9orf135Q5VTT2 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
C9orf135Q5VTT2 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
C9orf135Q5VTT2 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
C9orf135Q5VTT2 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
C9orf135Q5VTT2 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
C9orf135Q5VTT2 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
C9orf135Q5VTT2 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
C9orf135Q5VTT2 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
C9orf135Q5VTT2 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
C9orf135Q5VTT2 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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