Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDKN3Q16667 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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