Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HIF1AQ16665 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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