Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
USF2Q15853 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USF2Q15853 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
USF2Q15853 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USF2Q15853 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
USF2Q15853 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USF2Q15853 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
USF2Q15853 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
USF2Q15853 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USF2Q15853 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
USF2Q15853 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USF2Q15853 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USF2Q15853 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USF2Q15853 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USF2Q15853 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
USF2Q15853 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
USF2Q15853 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
USF2Q15853 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USF2Q15853 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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