Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITSN1Q15811 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ITSN1Q15811 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms