Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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SEC23BQ15437 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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SEC23BQ15437 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
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SEC23BQ15437 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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SEC23BQ15437 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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SEC23BQ15437 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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SEC23BQ15437 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23BQ15437 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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