Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCLAFQ15004 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PCLAFQ15004 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCLAFQ15004 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCLAFQ15004 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PCLAFQ15004 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCLAFQ15004 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCLAFQ15004 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCLAFQ15004 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
PCLAFQ15004 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PCLAFQ15004 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCLAFQ15004 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCLAFQ15004 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PCLAFQ15004 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PCLAFQ15004 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PCLAFQ15004 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
PCLAFQ15004 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PCLAFQ15004 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PCLAFQ15004 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PCLAFQ15004 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PCLAFQ15004 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PCLAFQ15004 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms