Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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