Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms