Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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CUL3Q13618 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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CUL3Q13618 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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CUL3Q13618 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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CUL3Q13618 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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CUL3Q13618 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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CUL3Q13618 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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CUL3Q13618 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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CUL3Q13618 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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