Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HDAC1Q13547 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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