Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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