Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATMQ13315 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATMQ13315 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATMQ13315 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATMQ13315 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATMQ13315 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATMQ13315 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATMQ13315 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATMQ13315 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATMQ13315 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATMQ13315 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATMQ13315 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATMQ13315 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATMQ13315 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATMQ13315 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATMQ13315 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATMQ13315 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATMQ13315 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATMQ13315 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATMQ13315 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATMQ13315 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATMQ13315 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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