Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
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RPA4Q13156 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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RPA4Q13156 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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RPA4Q13156 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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RPA4Q13156 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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