Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN3Q13064 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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