Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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HOXD10P28358 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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HOXD10P28358 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD10P28358 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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