Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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GDE1Q9NZC3 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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GDE1Q9NZC3 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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GDE1Q9NZC3 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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GDE1Q9NZC3 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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GDE1Q9NZC3 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GDE1Q9NZC3 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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