Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ9

KRTAP4-8, Keratin-associated protein 4-8, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-8Q9BYQ9 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 SGMS1-AS1-201ENST00000443374 12400 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 MAVS-201ENST00000416600 11596 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms