Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
LRRIQ1Q96JM4 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms