Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 DACT3-AS1-202ENST00000525008 496 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 DLST-216ENST00000626051 252 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39Q53RE8 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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