Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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