Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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DDB1Q16531 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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DDB1Q16531 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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DDB1Q16531 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
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DDB1Q16531 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
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DDB1Q16531 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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DDB1Q16531 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DDB1Q16531 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
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