Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TNXAQ16473 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms