Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SKIV2LQ15477 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
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