Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRAM2Q15035 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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