| RUNX2 | Q13950 | ABCG2-204 | ENST00000515655 | 4276 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KTN1-206 | ENST00000413890 | 4473 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF676-201 | ENST00000397121 | 2944 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR51A4-202 | ENST00000641898 | 4393 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CASC1-205 | ENST00000545133 | 2146 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC073325.2-201 | ENST00000339545 | 159 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR148B-201 | ENST00000362252 | 99 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.70-201 | ENST00000362886 | 110 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-78P-201 | ENST00000362897 | 107 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SKP32-201 | ENST00000410167 | 303 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL117339.3-201 | ENST00000418733 | 162 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL445989.1-202 | ENST00000418943 | 776 nt | TSL 2 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | INTS6-AS1-201 | ENST00000434512 | 466 nt | TSL 3 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL23AP58-201 | ENST00000440453 | 469 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02494-201 | ENST00000509824 | 427 nt | TSL 3 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1332P-201 | ENST00000516666 | 104 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP004607.1-201 | ENST00000524456 | 203 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP001318.2-201 | ENST00000533378 | 492 nt | TSL 3 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC131274.4-201 | ENST00000577879 | 398 nt | TSL 3 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC020895.1-201 | ENST00000595362 | 272 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL23AP78-201 | ENST00000599928 | 470 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008121.1-201 | ENST00000603244 | 268 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ELOCP5-201 | ENST00000604924 | 333 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC064836.2-201 | ENST00000609491 | 462 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL512625.3-207 | ENST00000609749 | 477 nt | TSL 3 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093913.1-201 | ENST00000614178 | 329 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC104260.1-201 | ENST00000616660 | 539 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | USP12-203 | ENST00000620323 | 349 nt | TSL 3 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UCA1.1-201 | ENST00000620952 | 75 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CUL3-203 | ENST00000409096 | 2701 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SCN1A-219 | ENST00000641575 | 12874 nt | APPRIS ALT1 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BCHE-201 | ENST00000264381 | 2454 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | N4BP2L2-211 | ENST00000504114 | 2513 nt | TSL 5 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MYOT-201 | ENST00000239926 | 2337 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR422A-201 | ENST00000362286 | 90 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA71.1-201 | ENST00000364523 | 117 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU5E-4P-201 | ENST00000364931 | 120 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009411.1-202 | ENST00000412424 | 548 nt | TSL 4 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ATG3P1-201 | ENST00000419507 | 911 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093151.1-201 | ENST00000427711 | 313 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL139397.1-201 | ENST00000430456 | 644 nt | TSL 2 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC095032.1-201 | ENST00000444810 | 527 nt | TSL 3 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OSTCP8-201 | ENST00000445117 | 448 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MRPL50P4-201 | ENST00000446432 | 475 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL035634.1-201 | ENST00000446768 | 372 nt | TSL 2 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TEX41-209 | ENST00000451478 | 452 nt | TSL 2 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC013470.1-201 | ENST00000453438 | 462 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AMD1P1-201 | ENST00000457220 | 922 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC107626.1-201 | ENST00000471084 | 183 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS26P21-201 | ENST00000475397 | 348 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS29P2-201 | ENST00000479278 | 136 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC012055.2-201 | ENST00000504167 | 335 nt | TSL 3 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SEM1P1-201 | ENST00000506694 | 209 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC103851.1-201 | ENST00000506833 | 274 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCYBP40-201 | ENST00000509390 | 1135 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092436.3-201 | ENST00000511788 | 257 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA43.2-201 | ENST00000516652 | 128 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009812.2-201 | ENST00000517657 | 457 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC103726.1-201 | ENST00000520785 | 474 nt | TSL 2 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | COPS8P3-201 | ENST00000526024 | 482 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBE2Q2P8-201 | ENST00000560644 | 102 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4506-201 | ENST00000584693 | 77 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC016866.2-201 | ENST00000585251 | 502 nt | TSL 2 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR1M4P-201 | ENST00000589199 | 287 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010620.2-201 | ENST00000600135 | 313 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL355877.2-201 | ENST00000603670 | 358 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005000.2-201 | ENST00000605468 | 310 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL008636.1-201 | ENST00000625038 | 1018 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U4.7-201 | ENST00000638126 | 106 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HDX-201 | ENST00000297977 | 6200 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OFD1P6Y-202 | ENST00000451061 | 2724 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNHG14-215 | ENST00000551631 | 4008 nt | TSL 5 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NEDD4-208 | ENST00000508342 | 7235 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CREBRF-201 | ENST00000296953 | 7778 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TAB3-203 | ENST00000378930 | 6255 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DCLRE1A-202 | ENST00000369305 | 4241 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093725.1-201 | ENST00000508135 | 2672 nt | TSL 5 BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DLEU2_6.3-201 | ENST00000340052 | 136 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1329P-201 | ENST00000365664 | 107 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA46-201 | ENST00000384762 | 135 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL122016.1-201 | ENST00000403365 | 367 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL356432.1-201 | ENST00000405809 | 419 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL590632.1-201 | ENST00000424289 | 371 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC117440.1-201 | ENST00000474107 | 571 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ODF2L-216 | ENST00000486215 | 311 nt | TSL 2 BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MRPL42P6-201 | ENST00000486397 | 371 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC069528.1-201 | ENST00000490344 | 705 nt | TSL 3 BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008526.1-201 | ENST00000509149 | 338 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP385-201 | ENST00000515947 | 110 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP341-201 | ENST00000516261 | 117 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-273P-201 | ENST00000516937 | 96 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MAPK1-204 | ENST00000544786 | 951 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC100830.2-201 | ENST00000581636 | 240 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC011471.1-201 | ENST00000585766 | 187 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091135.1-201 | ENST00000585943 | 307 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC024153.1-201 | ENST00000603103 | 365 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LARP7P1-201 | ENST00000605576 | 316 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC004832.5-201 | ENST00000608677 | 401 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBE2E2-206 | ENST00000613545 | 282 nt | TSL 5 BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DLEU2_6.2-201 | ENST00000620994 | 136 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |