Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBA3CQ13748 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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